نرم افزار AUTODIMER :

برنامه های مختلفی برای آنالیز پرایمرها وجود دارد. برنامه AutoDimer یک نرم افزار بیوانفورماتیکی است که می تواند تمام پرایمرهای شما را به طور همزمان آنالیز بکند. این نرم افزار در کاربردهایی که به طور همزمان از چند پرایمر استفاده می شود می تواند خیلی مفید واقع شود مانند Multiplex real-time PCR. این نرم افزار پرایمرهایی که مستعد دایمریزه شدن یا تاخوردن بر روی خود (ساختار ثانویه) هستند را نشان می دهند.

AUTODIMER: A SCREENING TOOL FOR PRIMER-DIMER AND HAIRPIN STRUCTURES

Several free software programs are available to analyze your qPCR primer designs and determine if they will be prone to dimerize or fold upon themselves. The AutoDimer program (authored by P.M. Vallone, National Institute of Standards and Technology, USA) is a bioinformatics tool that can analyze a full list of primers at the same time.

This is especially helpful with multiplexing applications. However, while bioinformatics analysis of primer sequences can greatly minimize the risk of dimer formation, it is still necessary to monitor dimerization experimentally.