یک روش جدید برای تشخیص سرطان در مراحل اولیه با استفاده از خون

یک روش جدید برای تشخیص سرطان در مراحل اولیه با استفاده از خون

تعدادی از دانشمندان حوزه ی سرطان به سرپرستی Dr. Daniel De Carvalho در مرکزPrincess Margaret Cancer Centre دانشگاه University Health Network، روش های “بیوپسی مایع”، “تغییرات اپی ژنتیک” و “یادگیری ماشین”، را تلفیق کردند و یک تست خون ابداع نمودند که می توان با استفاده از آن سرطان را در ابتدایی ترین مراحل دتکت و نوع سرطان را مشخص کرد.

این کشف که 14 نوامبر 2018 در Nature منتشر شد، نه تنها روشی برای تشخیص سرطان می باشد بلکه می تواند سرطان را در مراحل اولیه که درمان آن آسان تر است و خیلی قبل تر از اینکه علایم سرطان ظاهر شود تشخیص دهد.

دکتر کاروالو می گوید”ما بسیار هیجان زده هستیم. یکی از مشکلات مهم در سرطان، دتکت آن در مراحل اولیه است. اینکه یک موتاسیون را در بین یک میلیارد موتاسیون اختصاصی سرطان در خون شناسایی کنیم مانند پیدا کردن یک سوزن در انبار کاه است، خصوصا در مراحل اولیه که مقدار DNA تومور در خون، حداقل است.”

این تیم توانستند با تهیه ی پروفایل تغییرات اپی ژنتیکی بجای پروفایل موتاسیون ها، هزاران تغییر اختصاصی برای هر یک از انواع سرطان را شناسایی نمایند. سپس، با استفاده از یک پایگاه اطلاعاتی بزرگ، از یادگیری ماشین برای ایجاد یک ابزار کلاسه بندی کننده که می تواند حضور DNA مشتق از سرطان را در نمونه های خون شناسایی کند و نوع سرطان را مشخص نماید استفاده کردند. این کار باعث شد مشکل “یک سوزن در انبار کاه” به یک مشکل آسان تر یعنی “هزاران سوزن در انبار کاه” تبدیل شود.

این دانشمندان با آنالیز و مقایسه ی DNAی فاقد سلول در حال گردش در پلاسمای خون300 نمونه تومور بیمار از هفت قسمت از بدن بیمار (ریه، پانکراس، کلورکتال، سینه، لوکمی، مثانه و کلیه) و نمونه های سالم، منشا و نوع سرطان را ردیابی کردند. در هر نمونه، DNAی پلاسمای “شناور” را با DNAی تومور تطبیق دادند. این تیم پژوهش خود را توسعه دادند و در حال حاضر بیش از 700 نمونه تومور و خون را از انواع زیادی از سرطان ها پروفایل و به طور موفقیت آمیزی تطبیق دادند.

گام های بعدی تشخیص سرطان

بعد از مراحل آزمایشگاهی، گام های بعدی برای اعتبارسنجی بیشتر این تست شامل تجزیه و تحلیل داده های حاصل از مطالعات تحقیقات بهداشت جمعیت های بزرگ می باشد که در حال حاضر در چندین کشور در حال اجراست و نمونه های خون، ماه ها تا سال ها قبل از تشخیص سرطان جمع آوری شده است. سپس این روش باید در نهایت در مطالعات آینده نگر در غربالگری سرطان اعتبارسنجی شود.

دکتر کاروالو دانش آموخته ی ایمونولوژی (دانشگاه Sao Paulo ی برزیل) با تحصیلات پسادکتری در اپی ژنومیکس سرطان ( دانشگاه Southern California در ایالت متحده ی آمریکا) است که تحقیقات خود را بر روی اپی ژنتیک سرطان متمرکز کرده است. او عضو کمیته تحقیقاتی کانادا در زمینه اپی ژنتیک سرطان و اپی ژنتیک درمانی است و دانشیار اپی ژنتیک سرطان دپارتمان بیوفیزیک پزشکی دانشگاه تورنتو است.

این پژوهش توسط مرکز مک لافلین دانشگاه تورنتو، موسسه تحقیقات بهداشت کانادا، انجمن سرطان کانادا، انستیتو تحقیقات سرطان انتاریو و بنیاد سرطان شاهزاده مارگارت حمایت مالی شده است.

برای دانلود مقاله اینجا کلیک کنید

رفرنس مقاله:

Sensitive tumour detection and classification using plasma cell-free DNA methylomes. Nature, 2018; DOI: 10.1038/s41586-018-0703-0