delf

اطلاعیه بورسیه دکتری یا پسا دکتری در کشور هلند

بورسیه دکتری/ پسا دکتری در رشته بیوفیزیک

دانشگاه: Delf university of technology

 کشور: هلند

ددلاین: 30 ژوئن 2020

ما به دنبال یک دانشجوی با انگیزه بالا یا پسا دکترا با تجربه تحقیقاتی بیوشیمیایی جو هستیم. کاندیدای منتخب از فلورسانس تک مولکولی استفاده کرده و یک پلت فرم جدید آنالیز پروتئین تک مولکول برای بررسی تعامل پروتئین ها ایجاد می کند.

گروه جو (www.chirlmin.org  ) یک آزمایشگاه تحقیقاتی بیوفیزیک single-molecule در گروه Bionanoscience در TU Delft است. با استفاده از ابزارهای فلورسانس تک مولکولی، ما چگونگی تعامل پروتئین با RNA ، DNA و سایر پروتئین ها را بررسی می کنیم. ما پلتفرم های  تک مولکولی جدیدی مانند massively parallel single-molecule fluorescence و توالی پروتئین تک مولکول را توسعه می دهیم.

الزامات:

متقاضی باید دارای مدرک تحصیلی در زمینه زیست و علوم مرتبط باشد. دانش تخصصی در زمینه بیوسیمی الزامی است و تجربه در خصوص زیست شناسی سلول مزیت محسوب می شود. هم چنین کاندید مورد نظر باید توانایی بالا دراسپیکینگ و رایتینگ انگلیسی داشته باشد.

نیازمندیهای اپلای به شرح زیر به آدرس bionanoscience.delft@gmail.com ارسال شود

رزومه

کاور لتر

معرفی و اطلاعات تماس دو رفرنس

رفرنس:

https://www.tudelft.nl/over-tu-delft/werken-bij-tu-delft/vacatures/details/?jobId=274&jobTitle=PhD%20Position%20or%20Postdoc%20Biophysics

دانشگاه 0

اطلاعیه بورسیه دکتری در کشور هلند

بورسیه دکتری  synthesis and assembly of DNA-coated colloids

دانشگاه: Eindhoven University of Technology

کشور: هلند

ددلاین: 8 ژوئن 2020

ذرات کلوئیدی ذرات میکروسکوپی یا حتی نانوسکوپی هستند که سطح آنها میتواند عملکرد داشته باشد. بخش بزرگی از آنها نسبت سطح به حجم کمی که دارد ، به این معنی است که می توانید هرکدام را با مولکول های دیگری مثل دارو  بارگیری کنید تا داروها را تحویل داده و یا پاتوژن ها و نشانگرهای زیستی را در محل مورد نظر بسنجید و پتانسیل هایی را برای سیستم های تشخیصی و درمانی قدرتمند ایجاد کنید.

دلیل اینکه هنوز از این پتانسیل بهره برداری نشده است این است که این ویژگی ها به کنترل سخت و کمی تعداد ، توزیع و فعالیت گروههای شیمیایی در سطح ذرات بستگی دارد. حسگرهای زیستی مبتنی بر ذرات معمولاً با گیرنده های بیوشیمیایی پوشانده می شوند تا یک گیرنده آنالیت خاص یا غشای سلولی اتصال پیدا کنند. پاسخ سنسور به میل ، تعداد و توزیع گیرنده ها روی سطح ذرات بستگی دارد.

دانشجوی دکترا این پروژه، کلوئیدهای پلیمری را با یک پوشش DNA ترکیب می کند ، که به چندین محرک مانند نور ، دما و غلظت نمک پاسخ می دهد. این تحقیق به طور عمده تجربی خواهد بود و شامل طراحی کلوئیدهای پلیمری ، پوششهای DNA پاسخگو ، میکروسکوپ با وضوح برای توصیف پوشش و آزمایشهای بعدی درمورد مونتاژ کلوئیدی و برهم کنشهای بین ذرات می باشد. هدف نهایی این است که بتوانیم باعث تعدیل میل ، تحرک ، تراکم و / یا توزیع گیرنده های فعال بر روی سطح ذرات با استفاده از نشانه های خارجی برای دستیابی به اتصال فوق العاده انتخابی شویم.

برای این موقعیت PhD ، ما به دنبال یک کاندیدای مشتاق و با انگیزه با مدرک کارشناسی ارشد در علوم کلوئیدی ، شیمی فیزیکی ، فیزیک، علوم زیستی یا موارد مشابه هستیم. دانشجو  باید با شیمی کلوئیدی ، سنتز ذرات پلیمری ، خود مونتاژ ، DNA و میکروسکوپ کمی آشنایی داشته باشد. تجربه در زمینه های تولید ذرات و عملکرد و میکروسکوپ با وضوح مزیت محسوب می شود. مهارت های ارتباطی خوب به زبان انگلیسی (چه به صورت نوشتاری و چه گفتاری) لازم است.

مستندات لازم برای اپلای:

  • رزومه با معرفی دو رفرنس
  • انگیزه نامه
  • مدارک تحصیلی و ریز نمرات لیسانس و ارشد

رفرنس:

https://jobs.tue.nl/en/vacancy/phd-position-on-synthesis-and-assembly-of-dnacoated-colloids-845058.html

دانشگاه آیندهوو

اطلاعیه بورسیه دکتری در کشور هلند

بورسیه دکتری Real-time biomolecular sensing for closed-loop process control

دانشگاه: Eindhoven University of Technology

کشور: هلند

ددلاین:28 ژوئن 2020

محققان دانشگاه صنعتی  Eindhove در حال توسعه فناوری جدیدی برای سنجش مداوم بیومولکول ها هستند که Biosensing by Particle Mobility (BPM)  نامیده می شود. این فناوری مبتنی بر ذراتی است که به یک سطح سنجش متصل شده و تحرک آنها با اتصال مولکولهای آنالیت تغییر می کند. گروه Biosensing مولکولی این دانشگاه فناوری بیو سنسورینگ مولکولی را با رزولوشن single-molecule مطالعه می کنند. این تحقیقات منجر به ایجاد روش های جدید بیوسنسیگ مولکولی ، درک عملکرد پروتئین در فلوئیدهای پیچیده و مسیرهای جدید برای تست ها و مانیتورینگ شده است.  مهم ترین مقالات اخیر مرتبط با این پروژه به شرح زیر است:

ما به دنبال دانشجوی دکتری با استعداد و علاقه مند به توسعه فناوری بیوسنسور برای کاربرد در فرایند های بیولوژیکی و سلامت هستیم. این پروژه بر روی تاپیک هایی مانند کار با نمونه های میکرو فلوئید، آماده سازی نمونه، کالیبراسیون ، دقت و استحکام نمونه های بیولوژیکی پیچیده، کنترل فرایند closed-loop و … تمرکز دارد. داوطلبان باید در رشته های مهندسی و / یا علوم تحلیلی ، مهندسی فرآیند شیمیایی ، فناوری بیوپروسس ، شیمی تحلیلی ، بیوتکنولوژی یا علوم مهندسی فیزیک  سابقه ای داشته باشند.

مستندات لازم برای اپلای:

رزومه با معرفی دو رفرنس

انگیزه نامه

ریز نمرات لیسانس و ارشد و تز ارشد

رفرنس:

https://jobs.tue.nl/en/vacancy/phd-position-realtime-biomolecular-sensing-for-closedloop-process-control-848895.html

دانشگاه groningen

اطلاعیه بورسیه دکتری در کشور هلند

بورسیه دکتری  Virus Evolution and Genomics

دانشگاه: Groningen

کشور:  هلند

ددلاین: 21 جون 2020

پروژه:

ویروس ها قتبلیت آلوده کردن هر موجود زنده را از باکتری تا گیاهان و انسان را دارند. ویروس های دارای RNA با میزان جهش بسیار بالا مشخص می شوند که همراه با فاکتورهای دیگر دارای وجه تکاملی بسیار بزرگتر از پروکاریوت ها یا یوکاریوت ها هستند.این پروژه PhD بر روی محدودیتهای موجود در تنوع ژنتیکی RNA ویروسی تمرکز دارد، به ویژه تأثیر آلودگی ویروسهای مختلف بر روی جنس های مشابه بررسی می شود. به عنوان یک مدل ، ما از جنس Flavivirus استفاده خواهیم کرد که هم حشره و همآربوویروس ها را می تواند آلوده کنند.این کار شامل ترکیبی از تکامل ویروس، زیست شناسی مولکولی ، تعیین توالی ، تجزیه و تحلیل داده ها (آمار ، فیلوژنتیک) و مدل سازی خواهد بود.

صلاحیت ها:

  • مدرک کارشناسی ارشد در یکی از رشته های ویروس شناسی، تکامل و یا بیوانفورماتیک
  • مهارت ها در تجزیه و تحلیل داده ها ، آمار و برنامه نویسی
  • سطح خوب در اسپیکینگ و رایتینگ انگلیسی
  • اشتیاق به کار گروهی
  • علاقه مند به اکولوژی و تکامل ویروس

مستندات مورد نیاز برای اپلای:

  • کاور لتر شامل انگیزه اپلای برای این پوزیشن
  • رزومه شامل جزئیات لیسانس و ارشد و مقالات
  • اطلاعات تماس دو رفرنس برای کسب اطلاعات بیشتر راجه به کاندبد

رفرنس:https://www.rug.nl/about-ug/work-with-us/job-opportunities/?details=00347-02S0007QDP

دانشگاه سلطنتی KTH

اطلاعیه بورسیه دکتری در کشور سوئد

بورسیه دکتری در wood-based biocatalysis with a polymer focus

دانشگاه: KTH Royal Institute of Technology 

کشور: سوئد

ددلاین: 31 می 2020

آزمایشگاه Sirén در حال جذب دانشجوی دکترا در wood-based biocatalysis with a polymer focus برای پروژه SafeChem با گرنت MISTRA است. این پروژه با همکاری شرکای صنعتی بوده و در خط مقدم شیمی و بیوتکنولوژی قرار دارد. داوطلب باید برای یادگیری تکنیک های پیشرو از هر دو رشته انگیزه بالایی داشته باشد و به علم مواد علاقه داشته باشد.

هدف اصلی این پروژه توسعه روش هایی برای تولید بیوکاتالیستی بلوک های ساختمان مولکولی پیچیده از منابع تجدیدپذیر برای ترکیب در بیوپلیمرها است. حوزه تحقیق شامل طراحی و توسعه آبشارهای آنزیمی آزمایشگاهی برای گسترش قابلیت های فعلی طبیعت با توجه به بیوسنتز محصولات طبیعی است. دانشجو بر روی کشف آنزیم بر اساس رتوبیوکاتالیز و پیش بینی های مدل سازی مولکولی تمرکز خواهد کرد ، تا عملکردهای آنزیم پیش بینی کننده جدید را کشف و توسعه دهد. سوپروایزر ایم پروژه پروفسور   Per-Olof Syrén.می باشد

کاندید این پوزیشن باید دارای مدرک کارشناسی ارشد با فوکوس بربیوتکنولوژی، بیوکاتالیز، بیوشیمی یا فناوری پلیمریزاسیون باشد. دارای توانایی دمبال کردن امور به طور مستقل و روحیه تیمی بالا باشد. قابلیت آنالیز و تحلیل داده را داشته و دانش عمیقی از بیولوژی مولکولی، بیوکاتالیز، شیمی تحلیلی و مواد پلیمری داشته باشد.

مستندات مورد نیاز:

رزومه شامل دانش و تجارب حرفه ای

کاور لتر شامل علت ادامه تجصیل، علائق پژوهشیو اهداف آینده

کپی مدارک تحصیلی و ریز نمرات

مقالات چاپ شده

رفرنس:https://www.kth.se/en/om/work-at-kth/lediga-jobb/what:job/jobID:297361/type:job/where:4/apply:1

اوپسالا

اطلاعیه بورسیه دکتری در دانشگاه اوپسالا در کشور سوئد

دو بورسیه دکتری در Pharmaceutical Sciences, Treatment of bacterial infections

دانشگاه : Uppsala

کشور: سوئد

ددلاین: 18 جون 2020

دو پوزیشن دکتری در دپارتمان pharmaceutical bioscience  در دانشگاه اوپسالا موجود می باشد که بر روی درمان آنتی بیوتکی در عفونت های باکتریایی تمرکز خواهند داشت که برنامه تحقیق، تلفیقی از داروسازی ، ایمنی شناسی و میکروب شناسی می باشد. این پروژه ها شامل توسعه استراتژی های مبتنی بر مدل های بالینی برای شناخت روابط دارویی و اثرات ضد باکتریایی است. هدف این پروژه ها افزایش درک چگونگی انتقال نتایج بالینی به کلینیک و همچنین تأثیر سیستم ایمنی می باشد. همنین امکان استفاده از نشانگرهای زیستی برای فردی سازی درمان بررسی خواهد شد. این نوع مطالعات برای بهبود پیش بینی ها و پیشبرد آنتی بیوتیک درمانی برای افراد مهم است. داده های مورد نیاز برای برررسی مدل ها طی تستهای آزمایشگاهی و داخل بدن و همچنین مطالعات بالینی حاصل می شود. یکی از پروژه ها همچنین ممکن است شامل انجام  مطالعه بالینی باشد که در آن ارتباط بین نشانگرهای زیستی و پاسخ درمانی بررسی شود.

الزامات:

متقاضیان باید دارای مدرک کارشناسی ارشد در یک حوزه مربوطه ، مانند علوم دارویی ،بیوتکنولوژی دارویی یا پزشکی یا سایر تحصیلات مشابه باشد.

وی، بسیار با انگیزه باشد و علاقه واقعی خود را برای تحقیق در زمینه داروشناسی و عفونت های باکتریایی داشته باشد. انتظار می رود متقاضی مهارت های عالی در زبان انگلیسی داشته باشد. تجربه مدل سازی دارو و آنتی بیوتیک و برنامه نویسی با R  مزیت محسوب می شود.

مستندات مورد نیاز برای اپلای:

رزومه

انگیزه نامه

مدارک تحصیلی

دو توصیه نامه

تز ارشد

رفرنس:

https://www.uu.se/en/about-uu/join-us/details/?positionId=329287

بورسیه دکتری در دانشگاه اوپسالا در کشور سوئد

اطلاعیه بورسیه دکتری در Medical Cell Biology – Bioprinting of Tissues

دانشگاه : Uppsala

کشور: سوئد

ددلاین: 25 می 2020

دپارتمان: Medical Cell Biology

پروژه:

bioprinting سلول ها در ماتریس خارج سلولی مشخص، نشان دهنده یک رویکرد جدید برای ایجاد مدل های بافت سه بعدی می باشد. در آینده ، مدلهای بافتی سه بعدی پرینت به احتمال زیاد جایگزین بسیاری از مدلهای کشت سلول2D  موجود در حال حاضر در داشنگاه و صنعت شده و از این بافتهای سه بعدی نیز می توان برای پیوند استفاده کرد.

کاندیدای موفق در این پروژه بخشی از یک تیم تحقیقاتی بین المللی است که بر روی بیو پرینت مدل های سه بعدی بافت های با تکثیر بالا با تمرکز بر مدل های توموری از سل لاین های سرطان در ماتریکس فیزیولوژیکی کار می کند. مدلهای توموری سه بعدی پرینت شده برای استفاده در تحقیقات سرطان پستان در دانشگاه اوپسالا مورد ارزیابی قرار می گیرد و مقیاس بندی می شود تا امکان غربالگری آزمایشگاهی جدید از سرطان آزمایشگاهی را فراهم کند. این پروژه همچنین شامل bioprinting جزایرلانگرهانس ، متشکل از سلول های بتا تولید کننده انسولین انسانی و همچنین سلول های آلفا تولید کننده گلوکاگون که از اهمیت زیادی برای تحقیقات دیابت برخوردار است.، می باشد. مدلهای بافت زیستی توسط مطالعات پیشرفته برای بیان ژن و پروتئین مورد مطالعه قرار می گیرد

الزامات:

دانشجوی مورد نظر، باید دارای مدرک کارشناسی ارشد در مهندسی بیوتکنولوژی مولکولی یا مدرک معادل آن باشد. جاه طلب بوده  و  اشتیاق به علم و فناوری داشته باشد. خصوصیات شخصی ، توانایی کار مستقل و در عین حال قادر به تعامل با سایر محققان در سطح ملی و بین المللی بسیار مهم است. مهارت های ارتباطی بسیار خوبی در زبان انگلیسی در بخش نوشتاری و گفتاری طبق دستورالعمل دانشگاه Uppsala لازم است.

مستندات اپلای:

رزومه و کاور لتر

تاریخ شروع کار: 01-08-2020

رفرنس: https://www.uu.se/en/about-uu/join-us/details/?positionId=326067

دانشگاه اسلو

اطلاعیه بورسیه دکتری در دانشگاه اسلو کشور نروژ

بورسیه دکتری در Bioinformatics, Cancer and Chromatin Biology

دانشگاه : اسلو

کشور: نروژ

ددلاین: 15 جوئن 2020

این پوزیشن دکترا به مدت 3-4 سال ، در زمینه بیوانفورماتیک ، مطالعات کروماتین و اپی ژنتیک ، در انستیتوی علوم پزشکی دانشگاه اسلو می باشد. از طریق توالی NGS برای DNA ژنومی و RNA ، همراه با با تکنیک های اپی ژنتیک (ChIP-seq ، ATAC-seq ، MNase-seq ، Hi-C و مرتبط) ، می توانیم پروفایل ویژگی هایDNA ژنومی را از جمله تغییرات هیستون ، باز بودن کروماتین ، ترکیب کروموزوم و پروتئین های اتصال دهنده را تهیه کنیم  توالی DNA همچنین می تواند اطلاعاتی را در مورد تنوع ژنوم ، ترکیب ژن ، متیلاسیون DNA و بیان ژن نشان دهد. فن آوری های مختلف توالی یابی سلول به ما امکان درک تغییرات سلول و تعداد آن ها درون یک بافت را می دهد. ادغام مجموعه داده ها بتعث درک درست از میانکنش بین مولکول های بیولوژیکی و فرآیندهای موجود در زمینه های مختلف بیولوژیکی مانند سرطان می شود. چنین ادغام داده ها یک استراتژی قدرتمند برای ایجاد مدلهای جدید است که می توانند به صورت تجربی آزمایش شوند و درک ما از مکانیسمهای پیچیده بیولوژیکی / بیماری را بهبود ببخشد.

تمرکز این پروژه PhD روی قسمت غیر رمزگذار ژنوم خواهد بود. اثرات تنظیمی ممکن است به دلیل تغییر در کروماتین ، از طریق اختلال یا افزایش اتصال فاکتور رونویسی یا از طریق تغییرات ساختاری DNA متغیر باشد. دانشجوی دکترا باید اطلاعات ژنوم غیر رمز گذار را ادغام کند تا به درک مکانیسم های اساسی تنظیم ژن برسد ونشان دهد این موارد از طریق تنوع DNA در سرطان نقش داشته باشد،علاوه بر این ، گروه ما چندین دیتا بیس تک سلولی ایجاد کرده است و ما در حال آماده سازی غربال  CRISPRi به عنوان یک راهبرد برای سلول سرطانی هستیم.دانشجوی دکتری برای اطمینان از دسترسی به داده ها ، تجزیه و تحلیل داده ها ، توسعه و رشد تیمی با محققان بیوانفورماتیک همکاری خواهد کرد.

برای اطلاعات بیشتر به سایت  https://www.med.uio.no/english/research/phd/index.html . مراجعه شود.

الزامات:

دانشجو دارای مدرک کارشناسی ارشد در یکی از رشته های زیست شناسی مولکولی ، بیوشیمی ، زیست شناسی محاسباتی یا زمینه های مرتبط باشند.

دارای مهارت بالا در تسپیکینگ و رایتینگ انگلیسی

کاور لتر و انگیزه نامه

رزومه

ریزنمرات لیسانس و ارشد

مدرک زبان

فهرست مقالات

اطلاعات تماس دو رفرنس

رفرنس:https://www.jobbnorge.no/en/available-jobs/job/185773/phd-research-fellowship-in-bioinformatics-cancer-and-chromatin-biology

دانشگاه اسلو

بورسیه دکتری در دانشگاه اسلو کشور نروژ

بورسیه دکتری در رشته molecular biology

دانشگاه: اسلو

کشور: نروژ

ددلاین: 4 می 2020

این پوزیشن سه ساله تمام وقت در مقطع دکترا در گروه ژنتیک پزشکی ، انستیتوی پزشکی بالینی ، دانشگاه اسلو در می باشد. این موقعیت بخشی از پروژه با عنوان multiomics approach towards personalized medicine in rheumatoid arthritis است که توسط شورای تحقیقات نروژ تأمین مالی شده و به رهبری پروفسور Benedicte A. Lie انجام می شود.

هدف از این پروژه شناسایی اثرات مولکولی با ابزار بالینی برای تشخیص دقیق آرتریت روماتوئید و پیش بینی پاسخ درمانی به متوترکسات است. این بخش از پروژه بر روی شناسایی وزیکولهای خارج سلولی و حامل miRNA آنها در بیماران آرتریت روماتوئید متمرکز خواهد شد. این پروژه شامل NGS ، فلوسیتومتری، بیوانفورماتیک و آمار زیستی برای تجزیه و تحلیل چند عاملی خواهد بود.

الزامات:

  • متقاضیان باید دارای مدرک کارشناسی ارشد در زیست شناسی مولکولی ، بیوتکنولوژی یا زمینه های مرتبط باشند.
  • تجربه کار با DNA ، RNA ، پروتئین ها و سلول ها از جمله مهارت های عملی در ژنوتایپینگ ، qPCR ، وسترن بلات و تهیه کتابخانه های توالی سازی مورد نیاز است.
  • دانش و تجربه در کار با اگزوزومها و ردیابی نانوذرات یک مزیت است.
  • مهارت در تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک و آمارهای بیولوژیکی با استفاده از R نیز مزیت محصوب می شود.
  • دانش در زمینه ایمونولوژی و خود ایمنی نیز مهم است.
  • تسلط به انگلیسی

مستندات مورد نیاز برای اپلای:

  • کاور لتر شامل بیان انگیزه ، خلاصه کار علمی و علاقه پژوهشی ، حداکثر 1 صفحه
  • CV  شامل خلاصه آموزش ، سمت ها ، گرنت ها ، کمک هزینه ها ، تجربه آموزشی ، تجربه اداری و سایر فعالیت های مربوطه
  • کپی مدارک تحصیلی (فقط نسخه دانشگاهی)
  • لیست کاملی از مقالات و کارهای دانشگاهی
  • اسامی و اطلاعات تماس 2-3 رفرنس (نام ، ارتباط با نامزد ، ایمیل و شماره تلفن و در صورت وجود توصیه نامه کوتاه)

رفرنس:

https://www.jobbnorge.no/en/available-jobs/job/185855/phd-research-fellowship-in-molecular-biology

دانشگاه آمستردام

بورسیه دکتری در دانشگاه آمستردام

دانشگاه: آمستردام

کشور: هلند

ددلاین: 1 می 2020

گروه شیمی محاسباتی و فیزیک در مؤسسه علوم مولکولی Van ‘t Hoff در دانشکده علوم دانشگاه آمستردام به دنبال یک دانشجو دکترای بسیار با انگیزه و خلاق برای پیوستن به یک پروژه چالش برانگیز و بین رشته ای برای مطالعات تنظیمات رونوشت برداری است. تنظیمات رونویسی فرآیندی است که توسط آن یک بخشی از ژن بر روی DNA به RNA پیام رسان کپی می شود که شامل چندین پروتئین است. این پروتئین ها به توالی های دیگر DNA برای فرایندهای دیگر متصل می شوند و بنابراین بل توجه به مقدار کل DNA موجود، این پروتئین ها برای اتصال به مناطق پروموتور با هم رقابت می کند. با کمال تعجب ، این سطح از تنظیمات رونویسی هنوز به طور سیستماتیک مورد توجه قرار نگرفته است. با استفاده از رویکردهای محاسباتی و نظری ، قصد داریم مطالعه کنیم که با توجه به اندازه DNA در دسترس ، چگونه رونویسی تنظیم می شود. این پروژه با همکاری دانشگاه اوترخت می باشد و در دانشگاه اوترخت این موضوع به صورت آزمایشی مورد بررسی قرار خواهد گرفت.

مسئولیت های دانشجو:

شما با استفاده از روشهای شبیه سازی مولکولی شامل شبیه سازی دینامیک مولکولی میان اتم ها و توصیف اتصال پروتئین ها به DNA ، شرایط مختلف DNA در دسترس را پیش بینی کرده و نتایج را تحلیل و تفسیر خواهید کرد. شما نتایج خود را در ژورنالها و کنفرانس های بین المللی گزارش خواهید کرد.

الزامات:

  • کارشناسی ارشد در یکی از رشته های شیمی، فیزیک، علوم طبیعی و علوم محاسباتی
  • توانایی بالا در اسپیکینگ و رایتینگ انگلیسی
  • تجربه مدل سازی مولکولی مزیت محسوب می شود.

مستندات مورد نیاز:

  • رزومه
  • انگیزه نامه با توضیح علت اپلای برای این پوزیشن و تجربیات پژوهشی
  • عنوان و خلاصه پایان نامه
  • مقالات

رفرنس:https://www.uva.nl/en/content/vacancies/2020/03/20-187-phd-position-in-biomolecular.html?origin=qzYOHuMgQGaWLzn%2F4ST%2BQg

دانشگاه vrije

بورسیه دکتری دانشگاه Vrije در کشور هلند

بورسیه دکتری در TARGET AND UNTARGETED CELL-BASED METABOLOMICS AND LIPIDOMICS TO IDENTIFY MOLECULAR MECHANISMS AND PATHWAYS INVOLVED IN TOXICITY OF PFAS

دانشگاه: Vrije universiteit Amsterdam

کشور: هلند

ددلاین: 30 آوریل 2020

پروژه:

این پوزیشن دانشجوي دکترا در بخش محيط زيست و سلامت دانشگاهVrije Universiteit Amsterdam   و در چارچوب پروژه آموزش نوآوري Skłodowska -Curie (MSCA-ITN) Marie Marie بوده و عنوان پروژه  ” Per- and polyfluorinated alkyl substances towards the future of research and its communication in Europe (PERFORCE3) می باشد.

دانشجوی دکترا روی توسعه متابولومیک مبتنی بر cell- and organ-on-chip و رویکردهای لیپیدومیک با استفاده از قشر آدرنال انسان و سلولهای کبدی تمرکز خواهد کرد. از اهداف این پروژه این است که 1) بررسی مکانیسم های مولکولی درگیر در سمیت PFAS های جایگزین با تمرکز بر استروئیدوژنزیس ، سنتز کلسترول، متابولیسم و ​​حمل چربی ، 2) ارتباط مسیرهای متابولیک را با بیان ژن cohort انسانی و داده های متابولیک  و 3) ساپورت  AOP- و نشانگر تجاری

مسئولیت های دانشجو:

  • توسعه و نمایش مطالعات متابولومیکس و لیپیدومیکس مبتنی بر cell- and organ-on-chip با استفاده از کشت سلول و طیف سنجی جرمی (LC-QTOFMS ، GC-QTOFMS ، ,LC-MS / MS GC-MS)
  • تجزیه و تحلیل مسیر سوخت و ساز بدن ، و بررسی اثرات مطلاعات فوق در روش AOP

صلاحیت ها:

  • ما به دنبال یک کاندیدای دارای مدرک کارشناسی ارشد در (شیمی زیستی) تحلیلی ، سم شناسی مولکولی یا فارماکولوژی و / یا بیوشیمی هستیم
  • دانش و تجربه در مورد متابولیک ، لیپیدومیک ، طیف سنجی جرمی و کشت سلولی توصیه می شود
  • علاوه بر این ، داوطلبان باید توانایی کار مستقل و همکاری با دیگران را داشته باشند و مهارت های ارتباطی و نوشتاری قوی به زبان انگلیسی داشته باشند.

مدارک مورد نیاز برای اپلای:

  • Cover Letter ، بیانگر پروژه دکتری مورد نظر خود و شرح انگیزه و سوابق خود برای این پروژه
  • CV دقیق شامل مهارت های فنی و تحلیلی ومقالات
  • مدارک کارشناسی و ارشد ترجمه شده به زبان انگلیسی
  • خلاصه پایان نامه کارشناسی ارشد
  • اطلاعات تماس دو رفرنس

رفرنس:https://werkenbij.vu.nl/ad/phd-student-3-years-perforce3/je1knl

radboud university

بورسیه دکتری in Single-cell Multi-omics: Molecular Information Processing

دانشگاه: Radboud

کشور: هلند

ددلاین: 30 آوریل 2020

سلول ها در یک محیط پویا  و شلوغ حیات دارند و به تغییرات محیطی بدون توجه به آنچه در محیط اطراف سلول اتفاق می افتذ، پاسخ می دهند. پروتئین کینازها نقش اصلی را در انتقال “سیگنالهای ورودی” مربوط به سلول ، کاتالیز یا مهار واکنشهای شیمیایی ایفا می کنند و به موجب آن یک شبکه متصل به سیگنالینگ درون سلولی را تشکیل می دهند.

فن آوری های single-cell  انقلابی بود که به ما اجازه می دهد هزاران سلول را برای ترکیب مولکولی آنها نمونه برداری کنیم. تیم ما بر اساس این فناوری ها متمرکز شده اند تا مطالعه کنند که سلول ها چگونه سیگنال های ورودی دینامیک را پردازش می کنند ، و تفسیر این سیگنال ها در صورت بیماری یا فشار دارویی نیز کار دیگر تیم ما است. دراین پوزیشن شما به یک تیم چند رشته ای ملحق می شوید که قصد دارد قوانین “پردازش اطلاعات مولکولی” را کشف کند. به عنوان یک عضو گروه ، که شامل شیمیدانان ، زیست شناسان مولکولی ، مهندسین میکروفلوئید و دانشمندان محاسباتی می باشد ، در ابتدا روی طراحی محیط های دینامیک سلول کار خواهید کرد و از ابزارهای محاسباتی برای تحلیل داده های سلولی استفاده خواهید کرد. با همکاری نزدیک با دانشمندان آزمایشگاه، آزمایش های زیست شناسی سلولی را طراحی و انجام می دهید تا مجموعه داده های multiomics که حاوی اطلاعاتی در مورد وضعیت سیگنالینگ سلولی هستند را انجام دهید. درنهایت ، شما پاسخ به سیگنالهای ورودی طراحی شده، جریان اطلاعات در سراسر شبکه سیگنالینگ سلولی را مطالعه خواهید کرد. در طول پروژه ، شما با تکنیک های مدل سازی ریاضی ، بیوانفورماتیک کار خواهید کرد و این فرصت را خواهید داشت تا با استفاده از آن ها یا کمک به بهبود طراحی و ابزارهای تجزیه و تحلیل آزمایشات مبتنی بر میکروفلوئید، زیست شناسی مولکولی و فناوریهای single-cell کار کنید.

انتظارات از دانشجو:

  • دارای مدرک کارشناسی ارشد در رشته های زیست شناسی مولکولی ، بیوشیمی ، بیوفیزیک ، زیست مهندسی یا یک زمینه مرتبط
  • تمایل به علوم کامپیوتری وتلفیق کارهای آزمایشگاهی با کارهای محاسباتی. تجربه با سیستم های پیچیده ، بیوانفورماتیک ، مدل سازی ریاضی یا کار آزمایشگاهی (رونوشت های تک سلولی ، کشت سلولی) مزیت خواهد بود.
  • دارای مهارت های ارتباطی عالی و تمایل به کار در یک تیم تحقیقاتی بین المللی پویا
  • خلاقیت، تفکر تحلیلی و انگیزه قوی برای کار در خط مقدم علم
  • مهارت بالا در اسپیکینگ و رایتینگ به زبان انگلیسی
  • ·        32-40 ساعت کار درهفته

مدارک مورد نیاز برای اپلای:

  • انگیزه نامه شامل توضیحات آزمایش­های تحقیقاتی اخیر و اطلاعات تماس دو رفرنس
  • ریزنمرات لیسانس و ارشد
  • رزومه

رفرنس:https://www.ru.nl/english/working-at/vacature/details-vacature/?recid=1095870&pad=%2fenglish&doel=embed&taal=uk

اوترخت

بورسیه دکتری Bioinformatician/Data Steward Metagenomics

دانشگاه: اوترخت

کشور: هلند

ددلاین: 31 می 2020

دانشکده علوم، دپارتمان زیست شناسی، بیوانفورماتیک

متاژنوم مجموعه داده های پیچیده ای است که شامل اطلاعات ژنومی باکتری ها ، ویروس ها و سایر ارگانیسم های میکروبی است. در آزمایشگاه های سراسر جهان ده ها هزار نفر این مجموعه داده ها را با دستگاه های تعیین توالی DNA تهیه کرده و تصویری بی سابقه از دنیای میکروبی که در آن زندگی می کنیم را ارائه می دهند. در این پوزیشن، تحقیقات متاژنومیکس در دانشگاه اوترخت را به واسطه توسعه پایپ لاین دانلود و آنالیز ژنوم، آن را تقویت می کنید. پاسخگویی به سؤالات تحقیقاتی مربوط به میکروبیوم ، مانند پیش بینی تعامل باکتریوفاژها ، شناسایی باکتری های محرک رشد برای کشاورزی و درک نقش باکتری ها در بیماری هایی مانند سرطان روده بزرگ از مسئولیت های دانشجو است.

صلاحیت ها:

  • لیسانس یا ارشد بیوانفورماتیک
  • توانایی برنامه نویسی کامپیوتری (Python, R, Bash)
  • تجربخ کار با HPC cluster
  • تجربه مدیریت داده های تحقیقاتی
  • توانایی بالای برقراری ارتباط به زبان انگلیسی

مستندات مورد نیاز برای اپلای:

  • کاور لتر
  • رزومه که شامل ریز نمرات لیسانس و ارشد باشد
  • مدرک تحصیلی آخرین مقطع
  • اطلاعات تماس حداقل دو رفرنس

رفرنس:https://www.uu.nl/en/organisation/working-at-utrecht-university/jobs/bioinformaticiandata-steward-metagenomics-08-fte

دانشگاه virje

بورسیه در مقطع دکتری BIOPHYSICS AND MOLECULAR MODELLING

دانشگاه:Vrije universiteit Amsterdam

کشور: هلند

ددلاین: 30 آوریل 2020

ما به دنبال یک همکار جدید هستیم که بر روی یک پروژه دکتری در گروه بیوانفورماتیک در Vrije Universiteit Amsterdam کار کند. هدف این پروژه این است که رویکردهای جدیدی در توسعه بیومارکرهای زوال عقل ایجاد شود. آنچه مهم است این است که پیش بینی شود بیومارکرهای زیستی چگونه در یک محیط قادر به اتصال به آنتی بادی های خاص جهت تشخیص می باشند. آزمایشات بیوفیزیکی شبیه سازیهای بیوفیزیکی نقش مهمی در این تحقیق دارند. هدف خاص از پروژه PhD بررسی تغییر در حلال جهت اتصال پروتئین به آنتی بادی ها در ماتریس های مختلف بیولوژیکی است.

مسئولیت ها:

  • ایجاد یک الگوریتم برای پیش بینی دسترسی سطح خاص به ماتریس
  • مطالعه تجربی فولدینگ پروتئین ها در ماتریسهای مختلف بیولوژیکی با تعیین میزان دسترسی سطح ماتریسهای بیولوژیکی
  • مدل سازی مجموعه ساختار پروتئین حاصل شده
  • کار خود را با محققان زیست پزشکی ، بیوانفورماتیک و فیزیکدانان ارتباط دهید
  • نظارت بر تمرین های دانشجویان کارشناسی ارشد

الزامات:

  • دارای مدرک کارشناسی ارشد در رشته های بیوفیزیک، شیمی ، بیوتکنولوژی یا رشته های مرتبط.
  • دانش و علاقه زیادی به ساختار پروتئین
  • دارای تجربه  با پروتئین و  پروتئومیکس
  • دارای برخی مهارت های برنامه نویسی (و علاقه ای به پیشرفت بیشتر این موارد)
  • قبلاً نباید مدرک دکترا گرفته باشد

مدارک لازم برای درخواست:

  • رزومه شامل تجارب آزمایشگاهی و دو رفرنس که بتوان با آنان ارتباط برقرار کرد.
  • کاور لتر شامل انگیزه برای این پوزیشن و توضیح مناسب بودن شما برای این پ.زیشن
  • ریزنمرات کارشناسی و ارشد

رفرنس:

https://workingat.vu.nl/ad/miriade-esr3-phd-position-in-biophysics-and-molecular-modelling/r5xp0l